Szkoła w Borkach Wyrkach powstała 1 września 1921 roku, przez pierwsze lata swego istnienia nie miała stałej siedziby. Zajęcia odbywały się w prywatnych domach osób mieszkających w Borkach Wyrkach i Chromnej. Dopiero na początku lat trzydziestych XX wieku szkoła otrzymała pierwszy stały budynek, drewniany istniejący do dziś. Jednak społeczność lokalna cały czas myślała o budowie nowej szkoły. Wspólnymi siłami rozpoczęto budowę nowego budynku. Prace budowlane ruszyły w marcu 1953 roku i trwały siedem i pół miesiąca. Marzenia społeczności lokalnej i Pana Stanisława Świerczka, pierwszego kierownika szkoły zrealizowano 20 listopada 1953 roku.

20 listopada 1953 roku odbyło się uroczyste otwarcie nowego obiektu w Borkach Wyrkach, szkoły na którą z utęsknieniem czekały dzieci. W nowo wybudowanym obiekcie znajdowało się pięć sal lekcyjnych, zajęcia wychowania fizycznego odbywały się na korytarzu szkolnym. W szkole pracowało wtedy 4-6 nauczycieli. W 1973 roku odszedł na emeryturę pierwszy kierownik nowo wybudowanej szkoły Pan Stanisław Świerczek. Stanowisko dyrektora objął Pan Jerzy Grzyniewski i był nim do 1981 roku.

Kolejnymi dyrektorami szkoły byli:

1. P. Hipolit Popowski 1920-1924

2. P. Piotr Świerczek 1924- 1925

3. P. Adam Adamczyk 1925-1930 

4. P. Hipolit Popowski 1930-1936

5. P. Klaudiusz Gładkowski 1936-1949

6. P. Piotr Świerczek 1949-1950

7. P. Feliks Gerlib 1950-1951

8. P. Stanisław Świerczek 1951-1973

9. P. Jerzy Grzyniewski 1973-1982

10. P. Anastazja Bogaj 1982-1983

11. P. Ryszard Kosieradzki 1983-1984

12. P. Władysław Kubik 1984-1985

13. P. Hipolit Bąk 1985-1987

14. P. Teresa Borkowska 1987-1989

15. P. Tadeusz Marchel 1989-2015

16. P.Małgorzata Biarda 2015-2017

17. P. Urszula Niedziółka 2017-2018

18. P. Ewa Ząbek 2018 - 

W latach 1990-1994 szkoła przeszła rozbudowę i modernizację. We wrześniu 1993 roku rozpoczęto budowę sali gimnastycznej, którą oddano do użytku 1 czerwca 1994 roku. Uroczystego otwarcia dokonali: wojewoda siedlecki Pan Włodzimierz Pawluk i kurator oświaty Pan Wojciech Czepczyński. Odsłonięcia tablicy pamiątkowej dokonali: wójt gminy Zbuczyn Pan Kazimierz Pruchenka i przewodniczący Społ-kom. Dnia 16 października 1995 roku odbyła się uroczystość nadania Szkole Podstawowej w Borkach Wyrkach imienia Kornela Makuszyńskiego. Na uroczystość przybyło wielu gości: przedstawiciele kuratorium oświaty, władze samorządowe, rodzice i uczniowie. Po odczytaniu aktu nadania imienia szkoły odsłonięto popiersie patrona Kornela Makuszyńskiego.